胎兒在母體內的發育可分為3個時期。卵子受精后到18天左右為細胞增殖早期，此期胚胎尚未進行分化，用藥的影響不表現為致畸，而是導致胚胎死亡、流產或仍能發育成正常個體。卵子受精后3周～3個月（高敏期為妊娠21～35天）是胎兒器官發生期，這一時期胎兒對藥物最敏感，可導致各種致畸現象。妊娠3個月至足月為胎兒形成期，這一時期除中樞神經系統或生殖系統可因有害藥物致畸，其他器官一般不致畸，但可能影響胎兒的生理功能和發育成長。

　　畸形  妊娠前3個月是胎兒器官和臟器的分化時期，最易受藥物的影響而產生畸形。如反應停可引起胎兒肢體、耳、骨骼畸形；雌激素、雄激素和孕激素常引起胎兒性發育異常；抗癌藥氨甲喋呤可致胎兒顱骨和面部畸形、腭裂等；氮芥類抗癌藥可引起胎兒泌尿生殖系異常、指趾畸形；抗癲癇藥（如苯妥英鈉、三甲雙酮等）、抗凝藥（如華法令）、酒精等均可引起胎兒畸形。

　　中樞抑制或神經損傷  孕婦妊娠期服用鎮靜、安定、麻醉、止痛、抗組織胺或其他中樞神經抑制藥，可抑制胎兒的神經活動，并改變腦的發育。產程中給孕婦使用麻醉劑（如乙醚、氯仿等）、鎮痛藥（如嗎啡、度冷丁）、安定藥，可引起胎兒中樞神經抑制或神經系統損害，娩出的新生兒出現不吃、不哭、低體溫、呼吸抑制或循環衰竭等癥狀。

　　溶血  孕婦臨產期使用某些藥物，如抗瘧藥、磺胺類藥、硝基呋喃類抗炎藥、解熱止痛藥如氨基比林、大劑量脂溶性維生素K等，可引起部分紅細胞缺乏葡萄糖-6-磷酸脫氫酶的新生兒溶血。

　　出血  妊娠后期孕婦使用雙香豆素類抗凝藥、大劑量的苯巴比妥或長期服用阿斯匹林，可導致胎兒嚴重出血，甚至死胎。

　　器官功能損害  氨基糖甙類抗生素如鏈霉素、卡那霉素、慶大霉素等，可導致胎兒永久性耳聾或腎臟損害；妊娠5個月后使用四環素可使出生的嬰兒以后牙齒黃染、牙釉質發育不全、骨生長障礙；抗瘧藥氯喹可引起胎兒視神經損害、智力障礙和驚厥；長期應用氯丙嗪可使嬰兒視網膜病變；抗甲狀腺藥如硫脲嘧啶、他巴唑、碘劑，可影響胎兒的甲狀腺功能，導致死胎、先天性甲狀腺功能低下或胎兒甲狀腺腫大，甚至壓迫呼吸道引起窒息；產前應用氯霉素可引起新生兒循環障礙和灰嬰綜合征。