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用基因組分析技術找到肝癌轉移關鍵突變基因

  全程導醫網 健康焦點:上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院和國家人類基因組南方研究中心腫瘤基因組課題組韓澤廣教授、鄧慶博士與黃健研究員領銜的科研團隊,最近首次利用新型大規模基因組分析技術,找到肝癌轉移關鍵突變基因。相關研究論文于8月26日在線發表在國際頂尖學術刊物《自然·遺傳學》雜志上。專家認為,該研究結果將為肝癌診斷、預后、治療以及開發新型治療藥物奠定基礎。

  韓澤廣等科研人員與上海生物芯片國家工程研究中心、復旦大學附屬中山醫院、無錫市人民醫院等單位合作,利用DNA測序技術,對乙肝病毒感染相關的肝癌原發灶和侵犯肝臟門靜脈轉移灶的全部基因組外顯子進行比對分析,發現腫瘤細胞存在347個突變基因,平均每個腫瘤樣本有30個~40個基因突變,其中大多數基因突變是第一次在肝癌樣本中發現,并且在原發灶和轉移灶中同時出現,說明肝癌發病、轉移與基因突變密切相關,而轉移相關基因在原發腫瘤中即發生突變,而不是在腫瘤轉移過程中發生。另外,從堿基突變規律發現,突變除受黃曲霉素和內源代謝產物影響外,也可能與植物特定成分(如馬兜鈴酸)和塑料工業污染物有關。

  為了確定哪個突變基因在肝癌轉移中發揮關鍵作用,科研人員進一步在大量肝癌樣本中,對這些突變基因進行評估以及大規模的功能實驗分析研究。結果表明,大多數基因突變不是關鍵的,僅少數基因突變決定了腫瘤發病和轉移,其中ARID1A、VCAM1和CDK14等基因突變發揮關鍵作用。ARID1A和VCAM1基因在功能正常時,起抑制腫瘤細胞作用,當突變發生導致基因功能喪失或者表達降低時,腫瘤細胞會出現增殖加快、運動和侵襲能力增強。目前,科研人員已經發現,13%的肝癌患者發生ARID1A基因突變;VCAM1除了突變外,還在多數肝癌樣本中表達下降。而與細胞增殖相關的CDK14基因突變則會增強該基因功能,導致細胞生長加快,促進轉移,可能是肝癌治療新靶標。

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