徐州市兒童醫院新生兒外科是徐州市及淮海經濟區域內最大的一支小兒外科專業隊伍，是徐州市重點專科、徐州市醫學重點學科和徐州市優勢學科，擔負著蘇北、魯南、皖北、豫東四省20個地級市所構成的淮海經濟區約18萬平方公里、1.23億人口的小兒外科的預防、診斷、治療及急救任務。新生兒外科開放床位32張，10個單元搶救臺，現有專業醫師10名，其中正主任醫師2名，副主任醫師1名，主治醫師4名，住院醫師3名，在全國、全省都享有較高的聲譽。收治新生兒外科患兒逐年增多，近三來，每年達1000多例。在診斷和治療各種新生兒外科疾病方面具有豐富的臨床經驗，并取得了良好的治療效果。搶救了無數危重的新生兒患者并使其能同正常兒一樣生長發育。
二十多年來，隨著現代醫學技術水平的不斷發展，新生兒外科對新生兒疾病的診斷和治療水平形成了徐州地區及淮海經濟區的技術優勢，技術特色明顯，逐漸與國內外先進的新生兒外科疾病診治水平接軌，在省內處于領先地位。近年來，兒童醫院新生兒外科在中華級、國家級、部、省級雜志上公開發表論著60余篇，其中中華級8篇，曾獲省衛生廳新技術引進獎一等獎二次，獲省衛生廳新技術引進獎二等獎七次;獲徐州市科技進步獎二等獎二次，獲徐州市科技進步獎三等獎二次，獲徐州市科技進步獎四等獎一次，獲徐州市衛生新技術引進獎一等獎一次，二等獎三次，三等獎一次，獲獎等級及獲獎次數名列全市各級醫院中各個專科之首。
各種先天性畸形的診治及手術治療：先天性食管閉鎖和氣管食管瘺、胃壁肌層缺損、先天性肥厚性幽門狹窄、腸閉鎖和腸狹窄、腸旋轉不良、環狀胰腺、先天性巨結腸、直腸肛門畸形(伴有瘺或無瘺的高、中、低位無肛)、先天性膈疝、腹裂和臍膨出、脊膜膨出、骶尾部畸胎瘤、先天性膽道畸形(膽總管囊腫、膽道閉鎖等)、先天性卵巢囊腫等。
1、新生兒先天性食管閉鎖經胸膜外手術及頸部入路修補H型食管閉鎖。臨床上療效滿意，并發癥少，術后存活率高，生活質量高。
2、開展新生兒自體臍帶修補先天性腹裂，由于自體臍帶片是患兒自身的生物活動性組織，無毒性，無抗原性，并具有一定的彈性，修補后外觀滿意，能有效的減輕腹腔壓力，且取材容易，其效果優于既往的人工合成膜等，論文已發表在中華小兒外科雜志。
3、開展了新生兒高、中位肛門閉鎖一期經腹腔切斷直腸，剝離直腸粘膜、保留直腸盲袋肌鞘，然后在會陰前矢狀入路肛門成型(改良式Mollard術)，術后通過擴肛及排便訓練，手術后的患兒均有滿意的排便功能。這樣既解決患兒家長的經濟問題又避免了多次手術帶來的風險，改良式Mollard術治療先天性高位肛門直腸畸形，2007年獲得徐州市科技進步二等獎。
4、腹腔鏡下改良Soave’s巨結腸根治術治療新生兒及年齡小于2月的小嬰兒先天性巨結腸，所開展的例數在全國處于領先，微創手術，創傷小，恢復快，術后并發癥少，減輕了患兒家長的經濟和精神負擔，贏得了家長的高度好評，在腹腔鏡輔助下或經肛門完成巨結腸根治術近 300 例，隨訪效果良好;此外隨著靜脈營養的應用，越來越多的長段型甚至全結腸型巨結腸可以在新生兒期完成一次性巨結腸根治術。
5、對于嚴重危及患兒生命的先天性食管閉鎖的治療。自 1992 年開始應用呼吸機對食管閉鎖患兒進行呼吸管理，使食管閉鎖的成活率當時達到省內領先水平，至今隨著手術技術和新生兒監護水平的提高，很多低出生體重患兒能夠成活，現在沒有嚴重畸形的患兒的手術成活率可達 90% 以上。
6、腸閉鎖和腸狹窄的成活率明顯提高，近十年來治愈率已達到 95% 以上。
