為提高全國各級疾控機構早期發現和識別傳染病暴發、流行的能力，中國疾病預防控制中心研發、試點和完善了“傳染病自動預警（時間模型）信息系統”，并在此基礎上初步開發完成了“傳染病自動預警（時空模型）信息系統”。經與衛生部應急辦研究，于2008年4月21日在全國正式啟動傳染病自動預警（時間模型）試運行工作，同時在08奧運賽事舉辦城市、計劃單列市以及試點省份的215個縣（區）開展傳染病自動預警（時空模型）試點工作。
    “傳染病自動預警信息系統”是“中國疾病預防控制信息系統”平臺中新建的一套專用于傳染病自動預警的信息系統。該系統以縣（區）為單位，利用傳染病疫情監測報告數據建立數據庫，采用時間/時空預警模型每日自動運算，將探測到的病例異常增加或聚集的信號，以手機短信的方式自動發送給各級疾控機構疫情值班人員，提醒其及時關注和處理。目前系統共設置了29種預警傳染病，并對鼠疫、霍亂、SARS、脊髓灰質炎、人感染高致病性禽流感、肺炭疽及不明原因肺炎等重點傳染病，采用單病例實時預警。
    該項工作的啟動是首次在全國范圍內實現傳染病自動預警，將既往的研究成果轉化為可直接利用的資源，并進一步加強了對傳染病疫情監測報告數據的分析與利用。同時在部分地區開展傳染病自動預警（時空模型）試點工作，進一步采用時間-空間聚集性探測技術，利用病例的現住址信息，發現可能存在的病例聚集，深入傳染病預警研究工作。